PS:为了让我的小论文更有说服力,所以花了两天时间编写并大体调试完这样一个东西,基本上没什么技术含量,但是对于调试这个模型来说,感觉应该可能或许还是有点用处的。。。
先介绍一下这个水文模型:DHSVM模型是一个应用广泛的、基于物理机制的、完全分布式水文模型(我只希望写完这篇文章之后这辈子也不要再和这么垃。。额, 这么先进的模型扯上半毛钱关系)
PS:为了让我的小论文更有说服力,所以花了两天时间编写并大体调试完这样一个东西,基本上没什么技术含量,但是对于调试这个模型来说,感觉应该可能或许还是有点用处的。。。
先介绍一下这个水文模型:DHSVM模型是一个应用广泛的、基于物理机制的、完全分布式水文模型(我只希望写完这篇文章之后这辈子也不要再和这么垃。。额, 这么先进的模型扯上半毛钱关系)
一、算法:
MODIS积雪产品可以提供每天两景积雪数据,很容易想到,通过逐日比较积雪数据,可以确定“感兴趣区域”在任意相邻的两天是否发生了“降雪”或“融雪”事件。 这里可供选择的判断发生降雪或融雪的指标有:日内/日间积雪变化、日内/日间积雪反照率变化。
二、实施过程:
本程序是在之前写的一个积雪处理程序(http://user.qzone.qq.com/717191727/blog/1382349333)的基础上进一步编写而成的。
如下图
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终结篇:不务正业了近一个月,终于有点成果了,但是并行计算也就到此为止了,不能再做了,毕业的压力山大。按我本心来说,单纯做水文模拟实在是没劲,因为这就像,大道理谁都懂,可是真正做起来完全不是那么回事儿,那些“道理”在极其复杂的实际情况下未必就是对的,做这些非常不“靠谱”的试验就像是在玩扫雷,即便我最后通关了,要么是我知道这个地方有雷,而有意地避开了,要么就是我“运气好”,没有踩到雷而已。
扯回正题,先亮一下最后的结果:
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前言: 本文应该是个搞笑帖,但是如果你是做模型的,并且处于菜鸟阶段(这点最重要了, ),迫切希望提高模型的执行速度的话,那么文中提到的方法以及代码也许会对你有些帮助。
背景:说到并行计算,我想对很多人来说早就如雷贯耳了,并行计算目前有两个比较主流的应用手段:MPI , OpenMP (或者 二者配合)。很多人都“歧视”openmp,推崇MPI,认为openmp只不过是几个编译指令而已,很容易掌握,看起来没有MPI复杂,但是我可以说MPI也只不过是一堆消息传递函数而已吗,我个人认为MPI的主要难度在于对原始算法的修改,因为它一般需要一些数理基础。而OpenMP相对更加容易应用,而且实际上一般情况下,只能用OpenMP,这是因为:(1)MPI适用于“分布式多计算机”,也就是由多个计算机连结的工作站集群,我们所(青藏高原研究所)虽然有阳坤老师的一个由10个计算节点组成的工作站,但是由于我只是“下等”用户,每次最多只会分配给我一个节点,申请的节点多于一个就要无限期排队,这个先决条件就迫使我放弃MPI;(2)OpenMP适用于“集中式多处理器”,一台多核笔记本就完全满足条件了,而且,OpenMP的技术规范内容比较简单,易于掌握,可以实现快速应用,这对于我们这些“急于毕业”的人来说尤为重要。
搭建水文模型,最让人头疼的就是数据不全了,国内能够下载的气象站数据只有温度、相对湿度、风速和降雨,而且还全都是日值。而更为不幸的是,我最近在用的DHSVM模型需要的是小时值,而且还需要短波辐射和长波辐射数据。如何有效利用现有的气象站数据为水文模型做输入就成为我迫切要解决的问题。方法可能有很多,我这里实现了一个解决方案:利用VIC模型来进行插值转换。
题外话:按理说,VIC模型和DHSVM模型与华盛顿大学都渊源很深,可是VIC模型中有相应的插值模块,但是DHSVM中却没有。
VIC的插值算法大体是(可能我的表述不够准确):
(1)首先VIC利用每日平均气温和平均相对湿度估算出每日平均水汽压,在与每日最高温度和最低温度数据以及每日降水数据一起作为输入,使用蒙大拿大学开发的MT-CLIM模型,算出每小时短波辐射 。同时,会算出逐小时云量(后面会用到)
(2)根据上一步算出的每小时短波辐射判断出每日最高温度和最低温度时刻,建立Hermite多项式,保证在最低和最高时刻的一阶导数为0(从而保证了最低温度和最高温度与输入一致),插值得到逐小时的温度。
(3)VIC自身会通过经验公式,利用逐小时的温度和逐日的相对湿度计算逐小时的水汽压,然后利用逐小时的云量、温度和水汽压直接算出逐小时的长波辐射。
以上,是在我详细查看了VIC相关源码的基础上做的一点总结,可能不够准确。
在了解了VIC的工作原理之后,需要做的就是编写相应的接口程序来调用VIC的相应模块生成我们所需要的结果。而且,最好不要修改VIC的源码。所以,我就花了些时间,编写了一个 调用程序(源码贴在后面),没有改动VIC的源文件,只需要将我写的代码文件与VIC的源码文件一起编译即可。
它的使用方法是:
(1)有六个可选项,分别是,”temp”, “prec”, “srad”, “lrad” , “rh”, “wind” ,表示,你希望程序输出温度、降水、短波辐射、长波辐射、相对湿度或者风速。可以多选。如果要计算长波辐射、逐小时温度或者短波辐射,那么需要准备的输入数据是:逐日的降水、相对湿度、最高温度、最低温度和平均温度。如果要计算逐小时的降水,则只需要逐日的降水数据即可。实际上,此程序只会计算短波、长波和温度,其余变量只是简单的平均或填充一天。
(2)此外,用户还需要设置一些必要的参数,程序会在当前目录下寻找一个名为“parameter.txt”的文件,该文件内容如下:
因此,我在案例中也将这四项全部设为0,至于这四项具体影响有多大。进过简单测试,slope的影响很大,aspect几乎没有影响。slope为0应是假定没有地形影响,以这样的数据再在DHSVM中进行全流域distibute可能会更加合理。
我编写的源码如下:
注意:一个可行的编译运行方法是,下载VIC源码,并解压,将下面的代码复制到名为“vic_invoke.c”的文本文件中,并移动到解压后的目录。Linux下,输入命令:gcc vic_invoke.c Svp.c mtclim_wrapper.c mtclim_vic.c Vicerror.c Close_files.c Nrerror.c Compress_files.c Calc_air_temperature.c Calc_longwave.c -o vic_invoke -Wall -g -I . -lm即可顺利编译,然后./vic_invoke [option]运行。
如果要在windows下运行该程序,可下载安装MinGW,然后将下面源码中的LINUX宏设置为0,然后切换目录到VIC文件夹下,输入同样的编译命令即可生成win32可执行程序。
windows下直接运行,会弹出如下界面
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时间:大约从2011年8月开始
事件:基于张凡老师最得意的WASH123D模型,进行一系列河道参数试验,为了减少手动工作量同时减少我手动修改可能带来的错误 ,下面是我当时写的一部分Fortran代码(额,f77格式,基本使用gfortran编译,写得比较乱,在此备份,仅供以后参考或改进)
PS:其实,我一直想不明白,我当时为什么一定要用fortran写呢,唯一的理由可能就是闲的O疼了-_-!,令人欣慰的是,这部分工作为我换来了我的第一篇SCI论文。